赵昺在万州盘恒三日，又召见了刚刚从陵水县返回的万州知军蒋科，其是宝佑年间进士，曾任琼山教谕，其文采卓著，弘扬文教，廉法事教，颇有建树被举荐为宜伦ｗwｗ..lā＞≥在任上抚辑俚硐，教以诗书，深受俚人尊敬，帅府整饬吏治将其升任万安知军。
赵昺吩咐他蒋科用大军屯驻在此的机会，与俚人划定界线，约束其行为，减少与当地居民的纠纷，创造一个稳定的局面。其后他又叮嘱韩振要配合好地方工作，该出人出人，该出力出力。同时加紧练兵，做好战备，一旦有警，可以拉的动，用的上，顶得住。不仅能守住一方之地，还要做好随时增援琼州的准备。
赵昺的意思很清楚，他想将右军打造成一支水6两栖部队，即精于6战，又精于水战。这种考虑也是基于现实考虑，因为此时的水战可以说是6战的延伸，并非现代意义上争夺制海权的海战，而是以消灭敌人有生力量，削弱其战斗力为目的的战斗。
所以海战伤亡巨大是难免的，且海上行舟不可意料的风险也比6地上大的多，一场风暴便可将船只摧毁，溺死的人都是以千百论，更有甚者一支舰队都可能毁于一场飓风。而右军中的士兵多是由福建沿海地区的义勇组成，他们生活在海边，熟悉水性，适应船上的生活。让他们修习水战，一旦水军失利造成重大伤亡，可以让他们替代船上的战兵。
而让赵昺选定右军除了考虑到兵员组成外，还有便是主将韩振。其是殿前禁军出来的，而殿前禁军的主要任务便戍边和保护京师及皇帝的安全，受到的教育也是将忠于皇家放在第一位，耳染目睹之下多少怎么也会在其心中打下烙痕。再有韩振在禁军中地位不高，又有股二杆子劲儿，各方势力都不会将他作为拉拢的对象，也就是说政治上清白，不会轻易被朝中大佬们左右。
另一方面，跨海攻击敌占区，骚扰沿海，占领敌军海港，并摧毁他们的战船，借以打乱敌人的部署，将会成为帅府水军的一项常态话任务，而这些任务有的单凭水军是难以独立完成的，这便需要步军的配合。而这又要求配合作战的步军，不仅精通6战，且要熟悉水战。其作战任务和训练方式与现代的海军6战队类似，那经过两栖作战训练的右军便成为选。
当然赵昺安排不仅限于右军。中军是帅府军的核心力量，征战中其担负着警卫帅府及保证殿下安全的重任，因而就要求它擅于防守，而不是长于进攻，所以赵昺把中军作为守卫琼州的主要力量；前军是一军的先锋，主要作战任务便是逢山开路遇水填桥，攻城掠地，扫清大军前行的一切障碍，本应将其布置在琼州作为反击敌登6的主要力量，但因为后军之事，只能暂安置在‘大后方’吉阳军。
而后军基本都是新收编的义勇，战斗力最弱，赵昺最初才想将他们安排在琼州作为维稳地方的主要力量和后备军使用，却没想到屁股还未在琼州坐热便被江璆带到了雷州，参加了收复三州的战斗。此后几个月镇守于此又与敌多次生小规模的冲突，虽然造成了一定的伤亡，却在战斗中得到了锻炼，成为帅府军实战经验最丰富的部队。